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微软磁盘操作系统，MS-DOS，英语：MicroSoft Disk Operating System的缩写，一个由美国微软公司发展的操作系统，运行在Intel x86个人电脑上。它是DOS操作系统家族中最著名的一个，在Windows 95以前，DOS是ibm PC及兼容机中的最基本配备，而MS-DOS则是个人电脑中最普遍使用的DOS操作系统。
最基本的MS-DOS系统，由一个基于主引导记录（硬盘才有MBR，软盘没有MBR，引导扇区位于第0轨的扇区中，内容上与硬盘的MBR略有不同）的BOOT引导程序和三个文件模块组成。这三个模块是：输入输出模块（IO.SYS）、文件管理模块（MSDOS.SYS）及命令解释模块（COMMAND.COM），不过在MS-DOS 7.0中，MSDOS.SYS被改为启动配置文件，而IO.SYS增加了MSDOS.SYS的功能。除此之外，微软还在零售的MS-DOS系统包中加入了若干标准的外部程序（即外部命令），这才与内部命令（即由COMMAND.COM解释执行的命令）一同构建起一个在磁盘操作时代相对完备的人机交互环境。有关MS-DOS的各种命令，请参见MS-DOS命令列表。
MS-DOS用户可透过编辑两个位于开机磁盘根目录的系统文件来达到调控系统组态之目的，它们分别是CONFIG.SYS及AUTOEXEC.BAT，IO.SYS会检视CONFIG.SYS以加载指定的硬体驱动程序，而COMMAND.COM则自动运行AUTOEXEC.BAT所载的批量指令。
MS-DOS一般使用命令行界面来接受用户的指令，不过在后期的MS-DOS版本中，DOS程序也可以通过调用相应的DOS中断来进入图形模式，即DOS下的图形界面程序。
早先版本的MS-DOS为FAT12与FAT16，事实上也因为MS-DOS的流行，造成日后磁盘格式受到文件配置表影响相当巨大。从MS-DOS 7.0开始，尤其是MS-DOS 7.10版本则已全面支持FAT32、长文件名和大硬盘等。
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